有着复杂家庭环境的男主角夏目智春在三年前空难不测幸存后，末尾被自称守护灵的两小无猜水无神操绪依凭，在高中开学前搬进了其兄长夏目直贵曾寓居过的闹鬼房屋鸣樱邸，同日，穿着黑色服装的美女黑崎朱里受其兄长之托将银色手提箱交给了夏目智春，并唤醒了名为“机巧魔神”的谜之兵器以失掉此手提箱为契机，智春得知了世界隐藏的真实--神舍弃了人类，这个世界曾遭一次消灭，借助“恶魔”之力再生为“第二度世界” 被下达了必需运用兵器援救世界的智春，却又遇上了自称恶魔的巫女，还有异常被幽灵缠上的先生会长等人，男主角身边围绕了众多精彩的各型美少女们，轰轰烈烈的故事也该就此末尾了……
