16岁的速川唯虽然浑身上下只有跑得快这一项优点，却开朗地过着高中生的生活。某个满月的夜晚，她爱好发明的弟弟小尊发明了时光机，无意间触动开关的小唯穿越到了战国时代。清醒过来后，小唯陷入混乱状态，但总算冒名顶替以“唯之助”的身份混进步兵的队伍。就在小唯对未来绝望之时，一位年轻武士出现在她面前。他就是战国大名羽木家的嫡田羽木九八郎忠清。小唯对忠清一见钟情。后来，小唯被真正的唯之助的母亲若乃带回家。因为不知何时会返回现代，所以小唯一心一意想进城去和忠清见面。
小唯找不到方法见到忠清，正当她垂头丧气之时，听说家老要举行跑步比赛，天野家的选手怯战逃走，所以正在选拔家臣。小唯马上找到天野家的前任当家信茂说自己跑步的速度不输给马，终于获得了参赛资格。虽然小唯取得了胜利，但是天野信茂却看不上她，她只好暂且回到若乃家。小唯坚持不懈努力的结果是见到了忠清的异母哥哥成之。她请求作为步兵侍奉忠清，但却听说少主的未婚妻是阿湖公主。
小唯从战国时代回到现代，发现历史书上记载着少主忠清很快将战死沙场。为了救他，小唯决定再次穿越。弟弟小尊拗不过她，只好为小唯发明了防身武器电击剑“电电丸”。在又一个满月之夜，小唯回到了战国时代，仍与吉乃等战国农民住在一起。另一方面，羽木家与高山家的战争还在继续。忠清深感百姓的痛苦。而悄悄告诉他夺还城池的好机会的人竟是他的哥哥成之。小唯听说又开战了，决定加入步卒队伍守护少主，于是马上赶往主城。
小唯第一次经历汇战，大感震撼。在庆祝胜利的宴会上，她认识了剧团里扮演女角的彩芽。这天晚上，她惊讶地听说当地名门的女儿钟江的富纪要服侍少主忠清一晚。在彩芽的帮助下，小唯换上女装，代替富纪成功混入忠清的房间。怀着紧张的心情小唯终于与忠清见了面。忠清那寂寞的表情打动了小唯。交谈中，忠清看到自称“阿福”的小唯竭尽全力的样子，不禁笑了。小唯回到吉乃家后听说又要打仗了，急忙冲向黑羽城。这一次，将是对少主来说十分艰苦的战争。
为了拯救少主忠清率领的羽木军，小唯回到现代，带着弟弟开发的秘密武器重返战国。她为步卒“唯之助”跟在忠清的马后在战场上奔跑。因活跃而受赏识的小唯，在天野信茂安排下，当上了忠清的“御马番”。她为终于能跟随少主左右而开心，可工作却是天天埋头照料马匹。就在这时忠清要出远门，小唯抖擞精神为其牵马。在与这与忠清的初次“约会”中，她了解了忠清的想法，更加喜欢他了。在吉田城，忠清负责与高山家的和议。小唯发现有人阴谋暗杀少主，急忙跑去想提醒他，却迟了半步，一只箭射向了忠清。
忠清因被人暗算受伤，命在旦夕。小唯用时光机把他送到平成年代。见到忠清，速川家都吓了一跳，小唯的母亲美香子尽全力救了忠清的命。留在战国时代的小唯，本以为按照时光机的原理，忠清三分钟后就会回来，但等来等去都不见忠清。少主失踪，全城大乱。在成主策划下，小唯成了绑架少主的重要嫌疑犯。从城里逃走的小唯偶遇忠清的未婚妻阿湖。另一方面，在平成年代养伤的忠清很挂念小唯。他的贵公子作风令小尊等人非常着迷。得知史书记载自己即将战死，而且全族灭亡的命运后，忠清备受打击。不久后，又一个满月之夜到来，忠清将回到战国时代。
被时光机送到现代疗伤的忠清，因为发高烧没能按时返回战国时代。因少主失踪而背负嫌疑的小唯相信一个月后还有机会，一面等待忠清，一面逃避追捕。信茂把小唯藏在天野家。但是追捕小唯的人抓走了她敬如母亲的吉乃。为了救吉乃，小唯只得自投罗网。在牢里，小唯盼着满月之夜忠清能回来，但是忠清始终不见踪影。绝望的小唯因高烧昏倒。第二天一早，神志不清的小唯被带到城主忠高面前。城之褫夺了“步卒唯之助”的甲胄，小唯面临严重危机。
因救少主有功，小唯被委以少主的警卫之职，并且在天野家接受训练。另一方面，忠清与未婚妻阿湖公主相见了。这样一来，少主身边除了正等着成为侧室的富纪，又多了一位阿湖公主，小唯越发焦虑了。小唯追踪与羽木家敌人高山勾结的成之，却中了计，反而被带到成之的房间。随后赶来的忠清大怒。在吉乃鼓励下，小唯与忠清见面，说出了自己的想法，二人互通心意。在她应该回到现代的父母家的满月的夜晚，小唯与忠清骑马远足，浪漫的约会令小唯兴致勃勃，但她却不知这是最后一次使用时光机的机会了。
小唯回到了现代，得知时光机燃料用尽，所以她无法回到战国后，非常难过。她对少主的感情令弟弟小尊感动，他为小唯积存了只够往返一次的燃料。小唯告诉父母她一定要回去守护少主，送小唯走时他们与她约定一定要回来。小唯回到战国时代，时间离她上次离开时已经过了半年。忠清坚定了率领羽木家的决心，打算与松丸家的阿湖结婚。当与小唯重逢时，忠清高兴得不加思索就抱住了她。就在这时，小唯因意外事件与阿湖相约乔装外出，而敌人的魔掌也伸向了她们二人。
小唯与阿湖偷跑出城，却遭坏人追赶。为救阿湖，小唯与她换装，高山家把小唯当成松丸家的公主绑走。听说此事后，忠清拼命寻找小唯，与早就知晓高山家阴谋的成之刀剑相向。这时，高山家送信给松丸家，要让“阿湖”与高山家的继承人宗熊成婚。另一方面，宗熊与被扣押的小唯颇为投缘。小唯一边寻找机会逃走，一边鼓励备受父亲宗鹤压制的宗熊勇敢反抗。小唯逃跑失败，听说阿湖的哥哥义次来了，非常担心自己冒名顶替的事穿帮后小命不保。不过，就算蒙混过关，她也不得不被迫嫁给宗熊。面临危机的她却发现来人是忠清。
