静冈县三岛市有三所私立高校，除了每年东京大学合格生辈出的骏豆西高校（通称“西高”，学力偏差值66），另有圣三岛天主教女子高校（通称“三女”，偏差值60）和驹形大附属三岛佛教男子高校（通称“东高”，偏差值44）。三岛男子高校的校名并无“东”字，此通称为当地人为了和名校骏豆西高校做区别，在戏谑之下所取的昵称而行之有年。在“东高”担任国文老师的原平助（锦户亮饰）是一位普通男子，平日不擅长与女性相处，因14年前发生的事故，平助对家乡抱持一份特殊的责任感。某日，电车上发生了“三女”的女学生山田疑似被偷拍的事件，东高的男学生成田被怀疑是偷拍者，碰巧“三女”的生活指导教师蜂矢理沙亦乘坐同一班电车，蜂矢使出颜面膝攻击并将成田的手机没收。其后，平助、成田及学生会长半田前往对方就读的女校，欲要回成田的手机并澄清事件经过，没想到出面的即是三女的生活指导教师蜂矢，三人被蜂矢的气势所压制。因到三女旧地重游，平助亦回忆起就读东高时的初恋苦涩回忆。东高当年出借给三女游泳池，平助因而对三女学生蜂矢祐子一见钟情。在好友茑谷聪的鼓励之下，平助写了情书给祐子并邀其一起放烟火。当日，平助满心期待，祐子却失约。已买了烟火的平助将烟火带至学校并打电话邀聪一起放烟火，但语焉不详的聪似有隐情。先到了学校的平助，在顶楼赫然看见聪竟和祐子在隔壁三女的顶楼接吻。气愤的平助打电话给聪，但聪仍在说谎。聪瞒着平助和祐子交往，却同时鼓励平助追求祐子的举动让平助气愤不已，于是平助连续发射20枚烟火想击中两人却未果。伤心的平助奔跑回家后，母亲告知三女失火，平助认为是自己施放烟火时不慎造成三女教堂烧毁，深深自责。而因火灾事故，事发当时在现场的聪和祐子被警方留下制作笔录。其后，聪因缺课数过多遭退学、祐子则自请退学，两人不知去向。因14年前发生的事故，三女的学校经费已花用甚巨，在面临经营困难及当地少子化的趋势，使得三女不得不考虑与隔壁的东高并校。但两校“赞成派”和“反对派”各持己见，加上多年来两校之间的相处摩擦不断，因此欲改变现状的原平助提议两校先各自挑选出约15位三年级学生，和对方组成两班男女混合的实验性班级，采取为期半年的“实验性共学制”。平助亦趁机询问蜂矢理沙是否有个姐妹叫“蜂矢祐子”，没想到理沙仅冷淡的表示“已和姐姐多年没见面”。男女学生共学制实施之后，根据两校协议，原平助前往三女的“三年C班”授课，蜂矢则担任东高“三年三班”的导师。原平助带着班上男学生前往三女的“三年C班”时，却面临了一场始料未及的“震撼教育”。
因自我介绍时踩到三女“地雷”的原平助，持续的被女学生们瞧不起。在东高上课时临时被呼叫的蜂矢理沙，在平助的呼救之下像风一般的冲进三女教室并制服学生们。两位教师亦各自在对方的学校遭遇到各种适应期的状况。蜂矢则告知平助一些在女校授课的原则和要领，表示对女学生说话勿带有性别歧视的口吻，平助和保健室Don't Mind老师淡岛舞因而得知理沙原来被称为“Black Tiger”。而在两校多年来一向往来不睦的情形下，小情侣海老泽和阿部离家出走。正当两人的导师平助和理沙不知如何是好时，保健室Don't Mind老师再度发挥3C高超技术，冒充学生成田的帐号，从学生们的LINE聊天群组得知海老泽和阿部在五反田。海老泽和阿部要走入情人旅馆时，偶然被从情人旅馆走出来的原平助父亲原平太看见。原平太为了不让自己也在这种场所的事曝光，暗自将两位学生上宾馆的事压下并付出租车费用让两人回家，小情侣结束了短暂的私奔。隔日在学校，被蒙在鼓里的蜂矢向学校报告幸亏有“善心人士”的通知和帮助，才能找到两位学生。另一方面，平助在课堂上告知学生，两校其实在14年前一起合办过文化祭，只是因三女教堂烧毁而中止，而当事者茑谷聪和蜂矢祐子则遭受到旁人的责难，原本祐子仍坚强的上学，但其后也自请退学。又挖出伤心回忆的平助认为两校不应该为这些小失败而停止两校来往的脚步甚至不睦，身为一份子的自己也有努力的责任，甚至向班上的海老泽和阿部鞠躬道谢，表示十分感谢两人无惧强加在自己身上的校规之勇气。理沙在教室后方听见平助这番真诚的话，内心感动，请托平助拟定文化祭的企划书。某日，平助走进Girl's Bar，惊愕的发现在店里帮忙的竟是失踪多年的茑谷聪。而随后走进Girl's Bar的理沙，看见聪和平助，莫名其妙又错愕的在场三人瞬间面面相觑。
在Girl's Bar的原平助，惊讶的询问聪为何在店里？聪表示当年和蜂矢祐子共同身为文化祭执行成员时，祐子主动追求自己，甚至还邀自己去放烟火，当时回复了祐子“如果能去的话就去”。平助表示“这不是当年祐子回复我邀约的内容吗？”但聪表示，果然自己当年回复祐子的话，被祐子拿去回复平助了。聪向平助下跪坦承自己亲吻了祐子，并表示是祐子在三女顶楼说“想烧掉校舍，这样就可以男女并校”。此番似真似假的话让平助一头雾水，半信半疑。而蜂矢理沙则因姐姐疑似纵火的事件，学生时期总是被挑衅，才导致了现在以暴制暴、身手俐落的武斗派性格。理沙和平助在回家路上的谈话之际，一名伪装成神职人员的惯性猥亵犯出现，推倒了平助，所幸理沙出手相救。理沙提醒平助记得告知女学生提防猥亵犯。两校答应男女合班、推动文化祭，但前提是考试成绩必须达标，两项条件为“理沙在东高的班级必须全学年第一、平助在三女的班级不可垫底”，否则男女共学班解散、文化祭就此终止。为了达成目标，成绩较差的平助班级男学生前往平助家进行集训合宿。但基础不佳的数名学生仍对学习感到力有未逮。平助为了提高男学生学习意愿，请托班上成绩好的数名女学生对男学生们进行“一对一”教学。期间，因频繁的接触，阿部喜欢上了高大挺拔的东高学生会长半田，而阿部男友海老泽则伤心的发现了这个事实。平助亦从大木口中得知原来村井一直暗恋着半田。疑似新的“四角关系”诞生。特训后，考试结果公布，理沙在东高带的男女混合班一如预期全学年第一，但，平助在三女的男女混合班未达标。共学制宣布取消，男女学生必须回到各自学校。平助和三女班上的男学生，集体向女学生鞠躬道谢，感谢这段时期的相处。平助领着东高男学生走出三女学校时，正好与带着女学生回到三女的理沙擦身而过。理沙忍泪的表示对这结果“不甘心”，女学生的成绩不仅也提高了，重要的是，男学生们这段日子的努力令人感到敬佩。而这正是“男女共学制”的成果。听到理沙此言的平助，只能和理沙一样无奈的接受这事实。共学制取消后的翌日早晨，东高的第一堂课，曾在东高上课的女学生竟无视旁人的直挺挺走入东高教室，准备要上课。受到女学生鼓舞的男学生们见状，内心顿时熊熊燃烧，亦鼓起勇气冲向了三女教室继续共学制。错愕的平助和老师们阻止学生们未果。女学生会长中井站出来解释女学生们继续共学制的理由。校长和老师们受到感动。此时，经常出没猥亵女学生的谜样男子冲进三女校园，正当众人惊魂未定之际，在三女坚持共学制的男学生们瞬间纷纷冲出教室，压制了该名男子。理沙见状，欣慰的说道：“学校有男学生，还是很好的嘛！”而因为这一连串的变化，使得共学制得以延续。某日，在Girl's Bar，一名男子痛殴聪，理沙连忙制止，大喊“住手，老爸！”在店里的众人又是一阵错愕。
自14年前的火灾事故后，蜂矢家不断被地方人士暗中排挤，祐子亦离家出走而行踪不明，蜂矢父亲善人后来亦和妻子离了婚。而因顾及地方人士的眼光，父亲一直没主动寻找女儿祐子。认为是聪唆使祐子纵火的蜂矢父亲，无法原谅聪。而原平助亦借此机会在蜂矢父亲和理沙的面前坦承暗恋祐子，理沙惊讶。但平助未坦承自己施放烟火的事。学校里，因为两校计划合办文化祭，为了增进两校执行委员学生们的感情和熟悉度，学生提议两校的执行委员前往沼津市的海洋生态水族馆进行校外教学。两校校方亦欣然同意。保健室Don'tMind老师继续发挥个人3C技术，入侵SNS得知了学生之间剪不断、理还乱的暗恋关系图。“三女”校长吉井亦开始态度软化，和“东高”教职员们在Giri’sBar聚餐，并嫌弃席上的东高Don'tMind老师是丑女，Don'tMind老师深受打击。但吉井在一杯黄汤下肚后莫名其妙的和原平助父亲，即永乐寺住持原平太共枕眠。而因此突发事件，原本一早应到学校演讲的原平太宿醉不醒，儿子原一平只好代替父亲前往。不料，却在学校和Don'tMind老师邂逅，原一平瞬间感到爱神降临。校外教学当天，原平助和蜂矢理沙一同搭电车，途中，平助因站不稳不小心对理沙壁咚，纯情的理沙内心小鹿乱撞。到达海洋水族馆后，三女的学生会会长中井贵子向原平助告白。但中井亦向平助表示自己没有要交往的意思，只是想以这份心情努力办好文化祭；另一边，被阿部余和村井守暗恋的东高学生会会长半田豪鼓起勇气向理沙告白，表示理沙来东高上第一堂课发表“处女宣言”时，即迷恋上了理沙。半田要求和理沙交往。理沙闻言，害羞表示自己“要结婚了”。半田错愕，询问“对方是何人？交往多久？”理沙透露对方是原平助，甚至害羞的表示“没交往，但会逐渐爱上他的。因为是结婚对象”。理沙要求半田不得泄露她这个不为人知的“秘密”，并留下惊魂未定的半田在风中凌乱。原来理沙相信在三女流行的都市传说，在途中的电车上，恰好和平助同握一天才会出现一次的心型吊环，因而偷偷的认定平助是和自已共度一生的真命天子。回到学校后，认为应理性看待男女相处的平助，和鼓励学生追求真爱的理沙，分别在自己的课堂上对学生大聊自己关于恋爱的想法。理沙亦在学生询问下坦承“已有喜欢的人”。另一方面，脚抽筋的学生成田淳进入保健室，却撞见了原一平和Don'tMind老师。
原一平在演讲后邂逅Don'tMind老师，即对Don'tMind老师一见钟情，两人关系逐渐升温。而东高学生古井因和三女的超人气女学生山田·birkenstock·京子交往，引起了骏豆西高校（通称“西高”）男学生们的不快，西高男学生们在电车上群殴古井，并将过程上传至网络。被殴的古井在警局，因感到丢脸而坚决不承认被殴的事实。而因此事件，东高和三女的师生们得知原来两人正在交往。未有恋爱经验、单方面决定和原平助结婚的理沙对于自己是否喜欢平助感到困惑，虽然询问了Don'tMind老师的看法并上告解室找修女校长吉井商量，但心里仍是剪不断理更乱。在Girl'sBar，理沙听闻平助父亲曾经在平助面前推荐过自己，心中窃喜。不知东高校长“3D”星期五在电台兼职当DJ的理沙，向东高校长主持的广播节目《对不起青春！》留言。“3D”call out给理沙后，火速被理沙认出声音，两人鸡同鸭讲闹了笑话。另一方面，聪主动到祐子父亲的田里想帮忙，希望能取得祐子父亲的谅解，但皆遭祐子父亲的拒绝。父亲向来访的原平助表示，是自己当年在祐子被孤立、最低潮的时期未能帮助她，甚至对她冷言冷语，让得不到家人关心的祐子离家出走，自己对此事感到极为后悔，于是亦打电话进去“3D”的电台节目，将节目当传声筒对着失踪多年的女儿祐子喊话，表达后悔和歉意。而被西高群殴的古井，为了面子，答应西高学生提出的驿站接力赛要求，共学制班上的男女同学得知后，亦同仇敌忾的努力练习，想拿下比赛帮古井出气。另一方面，两校在平助的提议下，决议将合并后的校名取为“圣骏高校”（圣三岛女子学校和骏河国的合称），此校名亦和“青春”同音。而原本充满斗志加紧练习的师生们，却得知了实力坚强的飞毛腿古井又和西高起冲突闹进警局甚至被禁足一周无法参赛。学生们认为竞赛既是为了古井，这下主角缺席，这件事已经变得没有意义，女学生会长中井表示不如退出比赛。为了此事烦恼的平助，找古井相谈。平助才知道，古井是故意和西高学生打架，而这背后的理由，竟是为了让自己在比赛当天无法上场比赛。原来，古井另一个不为人知的身分即是扮演着当地著名的吉祥物“三岛小丸君”。古井因自小家境富裕，做很多事都缺乏斗志，直到阴错阳差之下接到扮演吉祥物的工作，并受到某个孩子的启发，态度才被这份工作改变，并把扮演吉祥物视为自己不可动摇的理想。比赛当天有扮演吉祥物的工作抽不开身，加上150厘米的身高限制，无论如何都找不到人代班，古井因而放弃比赛，只希望平助帮他保守秘密。回到学校后，平助试图说服学生继续参赛，但女学生会长中井表示无法理解古井退赛的原因，为何老师要替他说话？一旁的理沙看到平助语塞的模样，忍不住喊了某句话帮平助解围。学生们在平助和理沙两位老师的说明下，决定参加比赛。原最后一棒的古井，改由成田代替。另一方面，在保健室为学生擦药的Don'tMind老师，听到了原一平“已婚”的事实，不知道一平已婚的她，顿时天旋地转。而在家中的原一平，突然看见原平助房间的菩萨塑像化身为过世多年的母亲并对自己喊话，惊吓失色。化身为菩萨的妈妈，对着一平疾呼，表示“不正当的男女关系”，会受到惩罚！终于到了比赛当天，东高和三女学生斗志高昂，而古井亦忙着扮演吉祥物为同学加油，东高和三女的学生们都不知眼前吉祥物是自己的同学古井。
为了纪念东高三女合并，因此以“圣骏高校”的校名组成男女混合队伍形式参加“到箱根的马拉松接力赛”。在原平太的鸣枪之下，接力赛正式起跑。第一棒跑者中井一开始即位居领先，但后半距离却想起因家中因素，三周后必须转学的事，突然打乱速度；第二棒跑者半田也因想起自己的恋情，包括开始和阿部交往后，发生种种适应不良的情形，自己甚至转而接受村井的爱意而脑中一片混乱。而其后的海老泽、神保等棒次也因私人的烦恼，齐陷入思绪混乱中。最后一棒代替古井的成田没想到在路上脚受伤而无法继续前进，扮演吉祥物三岛小丸君且正在禁足处分状态的古井，在不想暴露身分的状况下，竟以吉祥物的装扮直接接过成田的接力带，代替成田跑最后一棒。另一方面，在平助老家永乐寺的原一平也陷入苦恼，看到电视转播里的Don'tMind老师，下定决心赶往现场。在比赛现场和Don'tMind老师见到面的一平，压抑不住熊熊的爱意，推倒了Don't Mind老师，Don't Mind老师一番欲拒还迎。而接力赛上，众人最后竟看到身挂圣骏高校接力带的“三岛小丸君”和西高选手冲向终点！吉祥物装扮里的古井拼了命的以第一名之姿冲过终点，但，亦因此而暴露身分。而原本担任最后一棒的成田，由原平助背著，最后自力走到终点完成赛程。因古井以未登录身分参赛之事，平助被要求到当地主办单位写始末报告书。理沙代替原平助上课，并向学生表示，自己原本亦认为得胜才是首要之事，但古井的作为事出有因，圣骏高校亦完成了比赛，如果每一次都轻易的取胜，日后的回忆亦不会这么刻骨铭心，有时，失败也是一种获得。接力赛落幕后，女校长吉井打电话进男校长3D的电台节目。不知道DJ真实身分是3D的吉井，透过电话向3D道歉。表示自己以前对3D的态度不佳，而且经过这次接力赛后，感受到男女学生之间和睦相处的纯粹幸福。3D闻言感动。文化祭即将到来，男女共学制的执行委员们加紧练习、分配表演节目事宜。女会长中井则因工作分配问题和其他同学意见不合。海老泽向中井再次告白时，得知了中井在三周后即将转学的消息。另一方面，原平太告知儿子平助，原一平似乎有婚外情，但不知婚外情的对象是谁，希望平助能查探究竟。平助奔回家后，一平向平助坦承了与Don'tMind老师之间的关系，平助惊愕。
得知哥哥一平和学校的Don'tMind老师发生婚外情的原平助，要求一平和Don'tMind老师分手。一平表示不忍心伤害Don'tMind老师，无法主动提出分手。另一方面，男女共学后的“圣骏高校”学生们正努力的准备着文化祭的节目，唯一知道女学生会长中井即将转学的海老泽，忍不住将转学一事告知理沙老师，并希望理沙帮中井保守秘密，因中井不希望因自己离校的事破坏班上气氛。得知转学一事的理沙，为了让中井好好利用剩余时间和原平助相处，于是将原本由中井负责的文化祭工作项目交待由其他同学负责；而因东高和三女各自有自己的校歌，为了产生合并后能代表两校的校歌，校方在理沙提议下，将创作新校歌的工作交由中井和原平助，理沙自己亦代替平助担任文化祭主要执行者，并表示中井和原平助只需专心在文化祭前完成校歌即可。中井猜测理沙老师应该已得知自己喜欢平助，所以才帮自己分担掉工作，制造自己和平助的相处机会。另一方面，和一平陷入婚外情的Don'tMind老师，得知一平是有妇之夫后，打电话进去校长3D主持的电台节目，吐露自己心声。一边哭着表示自己其实已有论及婚嫁的男友，感谢原一平担任自己的恋爱练习对象。听到节目的一平，深受打击而大哭。Don'tMind老师则和同校的体育老师富永展开交往。而被委托创作校歌的原平助，进度不甚理想，并因种种烦心的事情将此事搁置一旁。理沙得知后，心急的质问平助，平助在理沙的压迫下忍不住对理沙大声发火。不得已的理沙，虽然答应海老泽帮中井保守秘密，也只好对平助道出“中井即将转学，文化祭亦无法参加”的事实，这首歌即是中井送给大家的礼物，所以才想赶在文化祭之前完成。知道真相的平助，对于自己竟没发现中井异样的举动而感到自责。哥哥一平和Don'tMind老师结束婚外情之后，因消除了罪恶感，已不会看见过世的母亲显灵，只剩平助能看见母亲化身的菩萨。平助在母亲的劝说下，鼓起勇气想在班上坦承自己是14年前三女教堂纵火的凶手，但语未毕，即被台下穿着女校制服的男学生村井打断。村井突然向大家表示自己“喜欢男人”。文化祭前，原平助和中井终于创作出校歌，所有学生亦完成练唱。在女学生会长中井离校当天，平助、理沙和学生们瞒着中井，在中井离校的路上，众人在天桥上拉起为中井祝福的布条，为中井制造惊喜，中井感动落泪。而平助因之前对理沙发火的事向理沙道歉，理沙跑进保健室后，激动的向Don'tMind老师表示自己终于找到“未婚夫”平助吸引人的地方了。虽然之前将平助视为结婚对象，但总是无法真正喜欢他，直到这次，平常老是一副傻笑的平助，终于表露出自己内心真正的情绪。理沙对此感到异常的开心。而从未听闻理沙说过自己真命天子是平助的Don'tMind老师，此刻才知道原来理沙心仪的对象是平助，因而和理沙两人开心尖叫。另一方面，村井的父亲村井晋太郎，即东高理事长气势凌人的到学校找村井，却在同时间看到以女校制服装扮走入学校的儿子。
村井父亲看见女装打扮的儿子cosme之后，勃然大怒，认为学校没有进到管教之责，一气之下取消并校一事，三女的经营堪虑。而因为自己的缘故影响了两校师生，cosme为此自责落泪，同时表示自己从小即喜欢男生、喜欢穿女生的衣服。同学闻言皆支持cosme。原平助坚决表示文化祭（青春祭）已迫在眉睫，必须进行下去。而因两校共学制的取消，青春祭亦受到影响，为了让活动顺利举办，平助前往村井府上说情，但亦吃闭门羹。另一方面，平助从聪的口中得知，原来聪曾经因为外送可乐饼而和祐子见过面，当时祐子住在热海市的酒店中。但平助致电酒店询问时，祐子已不知去向。某日，平助从《对不起青春！》广播节目中听到祐子打电话进电台，祐子表示想对当年的聪道歉，并透露真正在脑中挥之不去的人，是聪当年那位鼓起勇气鼓励自己的“好友”。平助听到祐子的callin，奔向电台想要探听祐子的电话，却发现主持人竟是东高校长3D。平助和理沙再次前往村井家拜访。进门后，发现cosme的父亲，即理事长村井身着女装。原来理事长为了体验儿子的心境感受，购买了上百本“性别认同障碍”书籍来研究、甚至身着女装逛超市。虽被指指点点，但还是无法体会为何儿子会是女人心。理沙见状，向理事长表示请翌日务必到校，原平助会对村井父子进行一堂“特别授课”。走出村井宅邸后，将平助视为结婚对象的理沙，则因平助拖延唯诺的性格感到不耐，忍不住在路上对平助告白。理沙这场突如其来的生平第一次告白，却被来往的车辆打断。傲娇的理沙拂袖而去。翌日早晨，村井父子到校听平助的“特别授课”。平助的说明仍旧无法使理事长村井理解接受。但儿子cosme却忍不住泪如雨下，父子两人在情绪爆发之下反而对彼此坦承了内心的想法。理事长接受了“男身女心”的儿子。并对两校的校长表示继续共学制和青春祭，两校师生欢呼沸腾。正当两校忙碌准备青春祭时，平助将理沙叫到屋顶，想好好回答当天理沙的告白。平助对理沙表示，两人可以先从朋友做起。此时，平助似乎有其他话想说，但又表示改天再说。向来对不干脆的平助感到不耐的理沙，又忍不住对平助表露了不耐。而注意到自己这种态度的理沙，同时回过神来认为自己的性格太过急躁，平助喜欢的应是其他那种温柔的女生。理沙感到懊恼不已。平助见状安慰理沙，“这样的你很好。很完美”，并向理沙伸出友谊之手。理沙害羞的缓缓握住平助的手，甜蜜的傻笑着。另一方面，平助的父亲，即永乐寺住持原平太登录征婚网站寻找第二春。某日，一神秘女子前来永乐寺。而在学校，一位纪实报道杂志编辑前来东高采访青春祭，平助和理沙被叫到校长室。一进门的两人，震惊的发现眼前竟是14年来人间蒸发的蜂矢祐子。眼眶瞬间泛泪的理沙表示“是我姐姐”。
因为“青春祭”的取材而造访学校的蜂矢祐子，在Girl'sBar和父亲及妹妹理沙相隔14年之后终于见面。蜂矢善人为了当年冷漠的对待祐子而使其离家出走一事激动下跪道歉。然而，祐子的出现却让理沙心情万分复杂及低落，因而转身离开Girl'sBar。原平助见状，连忙追上理沙，理沙于是将平助当作倾诉的对象，把从小到大对姐姐祐子的不满一口气道出。平助不知如何安慰理沙，只能眼睁睁目送理沙离开。另一方面，原平太在婚姻介绍所认识的再婚对象节子来到了永乐寺，和原家一家人共同生活。两个儿子平助和一平对爸爸没和家人商量即擅自决定结婚对象，内心感到反抗。但家事万能、无懈可击的节子却让两人逐渐接受这个事实。而因姐姐祐子回家而感到尴尬的理沙，主动要求平助收留自己。平助和理沙两人连续10天同住一间房，却没发生任何事。理沙因此借机向节子学习厨艺，想做菜给平助吃。来采访活动的祐子，亦向原平太等人透露关于当年三女教堂失火事件，警方在现场有发现烟火燃烧的痕迹，平太则向祐子质疑为何当年要逃？若非凶手，主动离家不见踪影只会更让人起疑。其后，平太亦向儿子平助表示，其实当年的事件当天，平助母亲已发现平助样子不对劲，认为事有蹊跷。警察上门盘查时，平助父亲平太因不希望平助卷入事件，亦证言保护了儿子。而决定与节子再婚的原平太，亦打电话进《对不起青春！》表示想对已逝的妻子道歉，并回忆了过往妻子种种的好。在收音机另一边听到节目的节子，感动地了解了原平太妻子对原家一家人的不可取代性，因此默默的离开了原家。某日，平助将理沙约到天台，想坦承自己是当年三女火烧教堂事件的纵火者，并打算在青春祭之后辞职。刚为平助准备完晚饭开心赴约的理沙，错愕的听着眼前的平助细数14年前和姐姐的过往。平助向理沙表示已决定不当教师了，而且，当年纵火的人就是自己。过度惊讶的理沙一时无法接受，得知了原来这些年，家人被周遭人排挤、姐姐失踪、自己在学校被欺负等一切都跟平助有关。竟然是自己喜欢的人。濒临崩溃边缘的理沙眼泪夺眶而出，并愤怒的质疑平助，为何明天都要举办文化祭了，现在突然道出这些？难道以为不会被发现就不说么？平助表示对于多年来隐瞒一事，自己责无旁贷，但对理沙隐瞒这件事最痛苦，所以想第一个告诉理沙事件真相。原因是理沙是自己重视的人，“我喜欢你”。无预期之下听到平助告白的理沙，想起和平助之前在电车上同握心型吊环，反而牵起平助的双手，鼓励平助，表示虽然并没有原谅平助的作为，但会陪伴平助一起跨过这个难关。翌日，青春祭正式开始。
因文化祭而合并的圣骏高校“第0届青春祭”正式开始。原平助打算向蜂矢祐子坦承当年纵火事件的真相，但此举被茑谷聪发现，聪制止平助，害怕如此一来，平助会被祐子憎恨。聪并告知平助上次在广播节目《对不起青春！》，祐子曾透露自己真正喜欢的人是平助。但平助在当晚，仍在礼拜堂将事件真相告知了祐子。走出礼拜堂的祐子，遇见了妹妹理沙。两姐妹泪眼相对，理沙表示希望姐姐能原谅平助，让过去一笔勾消。祐子仅笑着表示“目前暂时做不到。”两姐妹重修旧好。另一方面，蜂矢和原家的两位父亲，在Girl'sBar谈及此事。已得知真相的原平太，亦向蜂矢父亲坦承当年纵火者是自己的儿子，两人发生了冲突。但因同样身为父亲、亦被火灾事件影响，双方产生了体谅的心情。青春祭第二天，已转学的中井贵子回校，受到大家的欢迎。晚上，学生们升起营火、老师主任们上台表演，炒热学校气氛。当晚在礼堂，亦颁发“青春先生”和“青春小姐”，获奖者分别是原平助和cosme。原平助趁著上台的机会，鼓起勇气向所有人坦承14年前纵火的真相。并表示自己当年为了赎罪，才选择当一名老师，接下来会辞去教职。三女校长吉井表示无法谅解，但一旁担任晚会主持人的神保说出“谁是真凶有什么关系。是纵火犯当了老师，又不是老师变成了纵火犯”。此句话被在场的师生听见，14年前只有4岁的此届学生们纷纷附和认同，亦表示若无原平助老师，合并、文化祭等，全部无法实现。此时，茑谷聪将警察领进了学校，并让警察解释了当年的纵火者并非平助。在校长室，教职员们、蜂矢及原家两家父亲一同倾听警察的描述。原来14年前的事故现场，以距离而言，平助要引发火灾的机率微乎其微，刑责追溯期已过，亦找不出真凶。翌日，青春祭结束，师生们收拾完现场后，成田代表所有青春祭执行委员，向即将离职的原平助表达感谢之意。平助听完了此番话，亦鼓起勇气在学生面前向蜂矢理沙大喊“我们结婚吧！”，理沙和现场学生惊讶。理沙害羞的答应了求婚。其后，聪和祐子一起在蜂矢家帮忙农作、即将结婚的理沙则在原家进行新嫁娘特训。而并校后的圣骏高校新任校长则是由原“三女”校长吉井担任，原“东高”校长三宫因在电台的兼差曝光，被降为顺位第三的训导主任。原电台节目主持工作则由辞去教职的原平助取代。毕业典礼当天，身着制服的平助踏进礼堂，一同和毕业生领取了“毕业证书”，正式毕业。
