故事时间已经过去七个月,Tom Mason被查尔斯顿人民选为新美利坚合众国的总统,而Dan Weaver上尉也荣升上校。为了营救在一个矿坑里打工的受奴役的地球青少年,抵抗军决定发动一次大规模的突击行动。负责看守矿坑的重甲战士和突击者全部被击溃,一切看起来都很顺利。
Ben Mason和他的搭档来到一处山头侦察Espheni的生产基地。Espheni以附近一座核电站为能量来源大批量建造超级重甲战士,许多受奴役的人类青少年因为感染核辐射而死亡。
在外星人入侵两周年纪念日到来之际,查尔斯顿的居民正忙着为另一次毁灭性的攻击做好防御准备。一个令人意想不到的狙击手发动令人意想不到的袭击,在新美国政府内部引发各种质疑和猜测。Hal确信他已经知道间谍的真实身份。Anne对Alexis的担忧与日俱增。
查尔斯顿的居民正忙着为TOM和沃尔姆人的首领进行谈判,然而TOM不知道的是他的儿子和医院的医生都是叛徒
Anne把女子Alexis的基因拿去检验了,发现ALexis的基因中混入了外星人的部分,Alexis已经不是人类了。随后Anne和Alexis被外星人掳走。Hal的女朋友开始发现Hal的不正常了。
当本集开始的时候,Tom Mason得知Anne和Alexis被Karen绑架,这让他难以接受。然而更让他难以接受的是……他的女儿Alexis不知为何带有一半外星基因!Hal Mason冲动地要立刻去救Anne和Alexis,但被Marina和Weaver上校阻止。
Tom和他的三个儿子踏上了救援Anne和Alexis之路,而途中因遭到皮克特一家的拦截失去了武器,另一边被沃尔姆人救回查尔斯顿的昔日美国总统被间谍医生所杀。拿回自己的武器的Tom因发现外星人于是返回提醒皮克特。
剧集开头,仿佛一切都没有发生,Tom还是过着正常的生活。直到他一直被引导回答去纽约、芝加哥、波士顿、杰克逊维尔的哪一个,感到不对劲的Tom终于醒了,并发现自己被Karen捉了。他的三个儿子都回到了查尔斯顿,在外星人防御罩打开的时候Tom也趁机逃走了。
萝狄斯安装的炸弹爆炸,炸伤了鱼头外星人。然后她又安装爬藤炸弹摧毁了大楼,正当大家努力救援受困人员时,Tom受到启发,找出了间谍——萝狄斯。
Tom他们打开了防护网,沃尔姆人的飞船也到了,但是沃尔姆人却要将Tom他们迁到巴西。最后,科考奇放了他们并返还了武器。之后有遇到并杀死了Karen,而且Anne和Alexis也回来了。