繁华大都会美国纽约，罪恶首领施莱德率领的大脚帮在城市内为非作歹，甚嚣尘上。安保公司老板埃里克·萨克斯（威廉·菲德内尔 William Fichtner 饰）推出最新安保系统，发誓维护城市的战争。第6频道女记者爱普尔·尼尔（梅根·福克斯 Megan Fox 饰）偶然拍到大脚帮被四名奥秘侠客挫败的画面，在第二次遭遇十分事情时，她惊讶地发现四名侠客居然是变异后的巴西龟：拉斐尔、列奥纳多、米可朗基罗、多纳泰罗。忍者神龟的名字勾起了爱普尔儿时的记忆，当年她的父亲与萨克斯正是研讨生物变异实验的同伴。她将这个音讯通知给萨克斯，可是在和忍者神龟及其教员斯普林特会面后，才觉察萨克斯与施莱德是这座城市内的罪恶之源……本片依据同名经典漫画改编。
