近未来的地球——人类由于一种被叫做HUGE的微妙生命体的出现而面临灭绝的危机世界各国为对付HUGE而协作制造出决战兵器CHARM，运用这些武器、被称为Lily的少女们为捍卫世界继续地战役着世界各地设立的Lily培训机构“Garden”成为了统一HUGE、守护人们的据点。在众多的Garden当中，入读被誉为名门的百合丘女学院的一柳梨璃，和邂逅的同伴们组成了一柳队，为执行义务而前往东京。以此为契机，鲁德比克女学院、爱伦斯基女学园、神庭女子艺术高校、御台场女学校、相模女子初等学馆，以及百合丘女学院的命运末尾交织……
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