故事发作在虚拟的未来世界，彼时，人类由于疏忽和大意而失掉了制海权，陆地，成为了人们可望而不可即的所在，盘踞在那里的，是一股名为“深海栖舰”的弱小权益为了同这股权益抗争，一群名为“舰娘”的女孩子们出现了，在她们的体内，栖息着舰艇之魂，亦是明日呢化身成为各式各样的战舰，为了人类的战争做着不懈的努力 素日里，舰娘们在名为“镇守府”的大本营里中止日常生活和训练，某日，一位名叫吹雪（上坂堇 配音）的生动女孩出如今了大家的面前，初来乍到的她趾高气扬，热情满满地参与了舰队的重生活中去，在这里，充溢了精彩和抚慰的日常就此展开。
