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哥谭市的一个夜晚，年幼的布鲁斯目睹父母韦恩夫妇被杀，暗处的喂猫少女也目睹了这起谋杀案。警探詹姆斯·戈登和搭档哈维·布洛克接手韦恩夫妇被害案，他们根据赃物认定凶手是马里奥，哈维为保护搭档而枪杀马里奥。企鹅人向重案组爆料，声称菲什才是真凶。
以杰罗姆为首的“疯子帮”正式开始了在哥潭市的犯罪之旅，很快就给警方一个下马威；与此同时布鲁斯韦恩因为蝙蝠洞中的秘密与阿尔弗雷德产生了争执，导致数据被毁，阿尔弗雷德不得已拉卢修斯入伙。
布洛克和戈登从杰罗姆的父亲开始追查线索，但是被杰罗姆抢先一步，证人消失，并留下了伪造的证据。在哥谭市的慈善晚宴上，疯子帮展开了新一轮的混乱，但是被戈登，布鲁斯，阿尔弗雷德，瑟琳娜联手毁灭，西奥见势不妙，杀死杰罗姆以灭口，芭芭拉逃脱。
正当企鹅人开始收拾杰罗姆留下的烂摊子时，西奥绑架了企鹅人的妈妈，以此来要挟他干扰市长选举，而哥谭警局换来了一位铁腕的新警督，在保护了一位市长竞选人之后，警督将下一个目标对准了企鹅。
企鹅不得不听从盖勒文的命令去指派一伙纵火犯盗窃一把奇特的古董刀，为了寻找盖勒文的弱点他追查了刀的线索，并从一名知道哥谭市百年内幕的老太太口中得知了盖勒文家族与韦恩家族两百年前的恩怨，企鹅由此得知了盖勒文的软肋并不惜牺牲布奇打入盖勒文一派的内部。
戈登到处寻找纵火人，好不容易抓到一个嫌疑犯尼诺但也并不是昨晚的纵火人，他寻找一个女纵火犯，但是尼诺根本没听说过。凯尔要想办法弄到钱，于是去地下贩女场进行大肆抢劫，让所有人把现金都装在布袋子里。
企鹅跟随布奇来到码头救母，却发现布奇已被塔比莎反洗脑，其实是带他踏入了陷阱。塔比莎当着企鹅面杀了他母亲，企鹅伤了西奥，勉强逃走。西奥以压倒性优势赢得选举，鼓动丹特和巴恩斯警监采取强硬手段通缉搜寻企鹅，戈登对其方法稍有微词。戈登和布洛克找到了布奇，布奇透露西奥才是幕后黑手。
尼格玛把柯丽丝汀的尸体带进林中想悄悄埋掉，却被人撞见。尼格玛不得不打死了他，然后去取工具打算肢解尸体，回来时又发现自己的三明治被吃掉，追随吃的人留下一路的血迹，却找到了企鹅。西奥说自己掌握了杀害布鲁斯父母真凶的资料，以此为筹码，要布鲁斯将公司卖给他。为了让戈登无暇顾及他，派芭芭拉去吸引戈登注意。
尼格玛把企鹅带回家照顾，由于丧母，企鹅完全丧失了斗志，有意离开哥谭。但尼格玛最终成功激励了他，两人成为犯罪搭档。塔比莎找到职业杀手，想买凶杀死戈登。然而第一位杀手却未能杀死戈登，于是杀手组织又派出更多人，将来到西奥顶层公寓取证的戈登、巴恩斯一行人困在楼上，最终巴恩斯受伤、另有警员身亡，但第二波杀手也被击退。
布鲁斯与塞琳娜设下苦肉计，终于揭露了茜尔薇的真面目，并套出了杀害布鲁斯父母真凶的名字。僧侣到处杀人，戈登查明他们是圣杜马修会，与西奥有一定联系，而且在完成一种血祭，要杀九个人，最后一个是“哥谭之子”。
