青山绿水间，一条巨大的白蛇从水帘中俯冲上来，在山间盘旋。不多时，这白蛇却幻化成一个素雅净美的女子，她一身白衣，在这青山绿水中唱起歌来，歌声萦绕山水间，更加氤氲缥缈。这女子名叫白素贞，经过了千年的修行，终于能幻化人形。妹妹小青本是一条小青蛇，也随了姐姐静音修行，一起幻化为人。白素珍此番费尽心思来到人间，正是为了寻找自己命中注定的有缘人。一千年前，白素贞还未得如此道行，她曾被一个小药童所救，从此便念念不忘。一千年间，天道轮回不断，已修炼成精的白素贞还是一眼就认出了西湖边的前世恩人。小青见姐姐的意中人踏上了游船，立即喊住船家，搀扶着姐姐踏上同一条船。白素贞与意中人一见如故，互报姓名和身世，原来恩人姓许名仙字汉文。一转眼，白素贞和小青便该下船了。小青调皮地施了法术，船在湖心突然剧烈地摇摆起来，许仙一个踉跄与白素贞碰在一起，他连连向面前的女子道歉。看许仙如此忠厚，白素贞心中更是大喜。四个月后，许仙与白素贞已经情真意切，暗许终身了。许仙将心上人带回家中，姐姐姐夫两人对白素贞也是喜爱有加。白素贞为助许仙立业，准备帮他开一家药铺。许仙的姐姐也很赞成，并说起城中正在闹瘟疫的事情。说来奇怪，有一个道观名曰“清虚观”，非常灵验，去拜过的人都会痊愈。若许仙能治好这次的瘟疫，那可谓是立下了大功。许仙面露愁容，而白素珍却说自己的祖师曾给过她一种专制腹痛的灵药，想要治好这病很容易。但想要根除瘟疫，还需要身为捕头的姐夫带人深夜守在城边最大的水井旁，查出城里闹瘟疫的真相。正如白素贞所说，一夜的守候果然有收获，原来正是“清虚观”的道长为了香火旺盛，才故意向这井中投毒。在白素贞的帮助下，许仙的药铺“保安堂”开张了，“保安丸”救了全城百姓的性命，许仙和白娘子也受到了全城百姓的拥戴。白素贞却因此事被道长怀恨在心。这道士故意与许仙搭讪，说他的娘子和丫鬟小青是蛇妖，而忠厚老实的许仙却不肯相信。道士心生一计，将一壶雄黄酒送给许仙。
端午节临近，大街上、院子里，到处都是雄黄的味道。雄黄具有驱赶蛇虫的功效，小青的功力不深，闻到这样的味道自然会感到不适，只好回到山涧中躲避一会儿。白娘子向许仙谎称小青出门看龙舟，姐姐跟随着姐夫回到娘家，眼下家中只有许仙和娘子两人了，许仙大喜，打开了道士送的那瓶雄黄酒，想要庆祝一下，白素贞不好推辞便小酌一口。没想到一杯酒刚刚下肚，白素贞就肚痛如刀绞，立刻飞奔到卧房，将帷帐一层一层地放下。许仙为娘子端了解酒茶来，看娘子在帷幔中不声不响，心疼不已。他轻轻走到床前，忽而一条巨大的白蛇从帷幔中伸出头来，将他吓得魂飞魄散。不知过了多久，白素贞才幻了人形醒来，却发现许仙已经吓晕了过去。小青此时也赶回家中，见到此情此前，立刻上前帮忙，却怎么也叫不醒倒在地上的许仙。白素贞内疚不已，决定前往阴曹地府，把许仙的魂魄救回来。此时，许仙已被黑白无常押解着上路，白素贞与这群小鬼大打出手，终于将许仙的魂魄带回了人间。不多时，许仙便苏醒过来，看到眼前的白娘子和小青，他再一次想起自己所见到了白蛇，又一次晕厥过去。白素贞只好施法术抹去了许仙端午节的记忆，好使他醒来后不会再起疑心。白素贞闯入地府救回许仙，让“清虚观”的道长大为恼火。他对白素贞怀恨在心，计划在她分娩时，趁着她法力减弱，再将她置于死地。这一晚，许仙姐夫又发现了道士在井中下毒，道士和他的小徒弟看到捕快们赶来便立刻落荒而逃。捕头带着一行人追上去，在一处荒草丛中，两人突然不见了。只见一只巨大的蜈蚣从草丛中蹿出，向众人袭来。等不到丈夫的姐姐焦急万分，白素贞掐指一算，原来姐夫此时正与蜈蚣精对峙。白素贞借口自己会幻术，自告奋勇带着小青去救姐夫。姐妹两人瞬间就飞走了，看到这样的法术，姐姐惊讶的半晌都没有回过神来。原来，这蜈蚣精就是“清虚观”的道长，许仙姐夫险些死在他的毒手下。幸好白素贞与小青及时赶到，打伤了蜈蚣精，救了姐夫一命。
赶走蜈蚣精后，白素贞突然感到一阵腹痛，想来是要生产了。突然一道金光洒向许仙家的院落，引得路人纷纷驻足停留。一声啼哭从许家传出，白素贞生出一个大胖小子。而这婴儿来头并不简单，正是天上的文曲星，受观音点画，投胎到许家，将来必定会成为人间的状元郎。许仙一家都沉浸在喜得贵子的欢乐中，许仙为孩子取名为许仕林，白素贞亲自为孩子求得护身符，保佑孩儿健康平安。这一切，也被老和尚法海所算到。法海收留了被白青两蛇打伤的蜈蚣精，听信了蜈蚣精的妖言，打算收了二个蛇妖。法海施法术将许仙带入幻境，告诉他白素贞和小青正是青白两蛇精，许仙不信。法海便为了解开了端午节的记忆封印，许仙得知真相后痛苦万分，但他仍然相信，即使妻子是妖，也是好妖，他绝对不能允许旁人伤害她。白素贞与小青找到了幻境中的许仙，却被法海拦住了去路。白素贞苦苦哀求法海能放过许仙，不料却被法海逼迫，水淹金山寺，触犯了天条。法海恼羞成怒，重伤小青，用金钵收了白素贞。白素贞最终向许仙讲述了两人的前世今生，并将她的孩子许仕林托付给姐姐照料。此后，白素贞被法海压在雷锋塔下，潜行修行。二十年后，许仕林高中状元，自会救她出塔。而许仙也夜夜思念妻子，终日以泪洗面，出家做了有情僧。
许仙找到法海，哭诉自己已看破红尘，愿遁入空门，潜心修行，将所修功德回向白素贞，助她早日得道，脱离苦海。法海见许仙痴心太重，将他留在门下带发修行。金山对雷锋，二十载秋冬春夏，许仕林已被姑姑抚养长大。他天生聪颖，才华横溢，许仙的姐姐只盼他能早日功成名就，好像弟弟夫妇二人交代。一日，许仕林误入“清虚观”中，险些被心存积怨的蜈蚣精所害，幸好他金身护体，吓跑了歹人。这一场横祸，让从小听惯了闲言碎语的许仕林终于按耐不住了，他跪在姑姑面前，询问自己的身世。许仙姐姐自知已无法隐瞒，便将一切告诉了许仕林。许仕林听后，为爹娘的冤屈大呼委屈，而今生母留给他的唯一信物就是戴在身上的那个锦囊了。仕林睹物思人，不觉泪如雨下。许仕林来到雷锋塔下寻找母亲，白素贞大喜，却只能和骨肉隔墙呼喊。她只盼儿能高中状元，好使一家团圆。从雷锋塔回来后，许仕林别过姑姑姑父，只身前往京城参加科举。漫漫江水，路途遥远，都不能阻止仕林的一片孝心，他与亲人挥别，踏上了船。
被蜈蚣精蒙蔽心智的许仕林高喊着报仇，冲进金山寺。给他开门的恰巧就是许仙，许仙为他的孩儿解开了心魔，劝他快快上路，考取功名，救出母亲。仕林看出，眼前这个带发僧人就是自己的生父，他跪拜父亲，请求父亲他是日一定要跟他回家，共同救出母亲。仕林一路跑回到岸边，他并不知道船家正想方设法谋害自己，便又上了此船。蜈蚣精哪里肯放过他，船至江心，这狠心的妖孽便露出了真面目，将仕林抛入江中。仕林的锦囊随之一同沉入水中，白素贞与仕林母子同心，很快就感受到了儿子的灾难。她不顾二十年的修行，打伤看守，从雷锋塔中逃出去救仕林。蜈蚣精作恶多端最终还是被法海发现，他百般狡辩，还是被法海收入钵中。白素珍将溺水的仕林救上岸，时隔二十年，母子两人终于相认。短暂的停留之后，白素贞回到雷锋塔，继续修行。仕林不忘娘亲的嘱托，跋山涉水，勤学苦读，终于抵达京城，状元及第。状元郎衣锦还乡，即刻前往金山寺，一路跪拜，求佛祖开恩，放白素贞出塔。法海眼看状元郎回乡祭塔，白素贞修行已满，终于将她放出塔。许仙一家人得以团圆，个个喜极而泣，终于修成正果。
