身在大都市的克拉克依旧受红色氪石的影响，迷失本性的他，犯下了许多错误。在得知克拉克的行为后，肯特夫妇担心不已。风流倜傥玉树临风的莱克斯在一个荒无人烟的孤岛上受尽折磨，特别是一个叫路易斯（Louis ）的家伙一天到晚在他身旁唧唧歪歪个不停。莱克斯终于受不了了，挥刀砍向此苍蝇。正在这时他被一个路过的船只发现，从而获救。然而荒岛上这一切究竟是真实？还是幻觉？老猴子莱昂怀疑海伦谋杀了莱克斯，并对整个过程作了福尔摩斯般的推理，不幸的是海伦坚决否认。不过莱昂警告海伦他是不会善罢甘休的。摩根找上克拉克，要和他合作，去莱诺卢瑟的办公室偷东西。为了带回克拉克，乔纳森和乔艾尔做了一项交易乔纳森愿意牺牲一切换回克拉克。随后乔纳森获得了超级能力，在莱诺的办公室里与前来盗宝的克拉克较量了一番，最终双双从高楼破窗而出。
乔纳森和克拉克打得难分难解，最后克拉克自己毁掉了红色氪石戒指，恢复了正常，跟着父亲回到了农场。莱克斯以为是父亲莱诺设计了自己，回来找父亲算帐，莱诺却认为是海伦做的。莱克斯去找海伦，海伦却有自己的解释。最后莱克斯查明了真相，在一次自己安排的飞行上和海伦摊牌，打斗中海伦坠机失踪。莱克斯与父亲达成了谅解。摩根从大都会回来找克拉克归还要他偷的东西，克拉克不肯，摩根用他的父母威胁克拉克，克拉克只有用氪石划伤自己取出血给摩根并告诉他这就是偷的东西，摩根也因此发现克拉克的弱点。摩根发现莱诺非常重视这血液，就告诉莱诺要用血液的来源与莱诺交易，摩根将克拉克抓来。紧要关头克拉克撕掉摩根手下把氪石粘在自己身上的胶带，恢复了超能力逃脱。克拉克仍然不肯向拉娜坦诚，拉娜很失望。
一个叫Jake Pollen的鱼鳃人在游泳池袭击拉娜时被人用枪击毙。克萝依不想再调查克拉克，莱昂却威胁要解雇她的父亲，克萝依只有服从。克拉克发现同学van很可疑，调查后发现他的神秘小屋有很多枪械和一些受陨石影响的人们的照片，原来因为父亲死于变形人提娜后，van就开始计划猎杀所有知道的受陨石影响的人。（他认为是“怪物”，都该死）。克拉克在 van枪击莱克斯的瞬间救了他，却让van知道了自己的超能力和致命弱点。van用绿色陨石子弹打伤了克拉克，van在逃亡时向拉娜求助，拉娜不从，争执中克拉克赶到，这次他穿了避弹衣。
克拉克不断在现实和梦境中交替，在梦境里遇到一个叫sara的女子不断向他求助，她说总是有人要追杀她，一个穿红色斗缝的有强大力量的人。原来这个女子是新搬来的邻居，一个陷入长期昏睡的女子，现在由他的叔叔监护。克拉克查出正是他的叔叔贪图Sara父母的遗产，用药物使sara不能醒来。sara入了克拉克的梦使他不能及时醒来，sara的叔叔在拉娜独自查探他的时候制服了她。在梦中克拉克说服sara克服恐惧并击退了红色斗缝。最终sara醒来，克拉克及时跳出梦境并在sara叔叔手中又一次救了拉娜。莱克斯为了取信父亲，同意接受心理调查。
克拉克在车祸中救了一个叫怀特的记者，他似乎不肯定地发现了克拉克的超能力。他对拉娜的采访引起了拉娜的巨大反感，莱克斯威胁了他并把他送到了回大都会的路口。在太阳黑子的影响下，克拉克的超能力时有时无难已把握，他失控将拖拉机抛向空中落到等车的怀特的面前，又速度失控跑到了几千里外的塔霍湖回不来，他终于见识了真正的克拉克的超能力。他决定留下来对克拉克进行追踪报道。莱克斯和心理医生不太配合，他不认为自己精神上有任何问题。怀特为了引出克拉克使用超能力，在峡谷的一条桥上假装自杀。克拉克却刚好不能使用超能力，在拉娜和皮特的帮助下，他们救起了差点掉下峡谷的怀特，看到受伤的克拉克，怀特非常内疚，最终放弃了调查。
克拉克通过触摸亲生父亲Jor-El留下的氪星首饰感受到42年前的一段情景，原来，他的父亲当年被派来地球接受成人的考验时爱上了一个女孩（恰巧是拉娜的姑姑），后来卷入了这个女孩的被谋杀案。在逃走的时候Jor-El得到了乔纳森父亲的信任和帮助。克拉克这才知道，原来小时侯他被送到肯特农场不是偶然的。
暗恋拉娜的zegers受伤后在医院接受核磁共振时获得了神奇的磁性控制能力，他控制了拉娜的思想，使拉娜不由自主地喜欢上他。莱克斯开始调查小时候祖父母死于火灾的真相，他怀疑是父亲做的。他意外发现克萝依也在调查莱昂。原来克萝依也想掌握莱昂的犯罪证据，莱克斯警告克萝依与莱昂的交往很危险，而他却可以保护她，克萝依考虑和他合作。zegers与拉娜约会，克拉克警告zegers。zegers却纵勇拉娜偷窃塔龙的钱，在他们远走高飞的时候，克拉克融化了路面使汽车陷住，zegers逃了，拉娜被警察捉住。拉娜将克拉克骗走，zegers回来带走了拉娜。克拉克及时制止了zegers，拉娜被判社会服务令。
莱克斯找到了整容之后的摩根，收集了莱昂伙同摩根杀死祖父母骗取保险金的证据。在知道莱克斯调查自己之后，莱昂安排保镖给莱克斯下迷幻药，并安排了一次假刺杀，让别人认为莱克斯发疯了。开始克拉克很相信他，收留了他，他却不定时出现了小时侯的一些幻觉，拉娜被意外受伤。莱克斯用枪威胁了莱昂，取得了摩根的地址，只身上门单挑。同时克拉克查出是莱昂捣鬼，前往救助莱克斯，最终克拉克在莱克斯面前用超能力救了他。但没有人相信莱克斯说的话，莱昂的人将他送进了精神病院以便更好地控制他。
克拉克到精神病院看望莱克斯，同时见到了关在这里的Van,Eric和Ian,莱克斯求克拉克用超能力救他出去，克拉克没有答应。知道莱克斯逃跑失败后被严密禁锢起来，克拉克很内疚。拉娜在疗伤的过程中认识了病友Adam，adam的关心和鼓励令她增强了治疗恢复的信心，并对颇有好感。Van买通警卫拿到了绿色陨石，双身人Ian取得陨石后杀死了他，和电力小子Eric合作，在克拉克探望莱克斯的时候用陨石制服他后把他捉走，Eric用陨石和电击的方法转移了克拉克的超能力，又立刻干掉了Ian。但是经过一翻打斗后克拉克又夺回了自己的超能力。莱昂对莱克斯使用了冒险的电击疗法，希望取消莱克斯的近期记忆，他成功了。而莱昂似乎知道克拉克有一些不为人知的秘密。
在一次制止抢劫珠宝店的事件中，克拉克被绿色陨石发出的光芒把眼睛灼伤了，暂时失明了。但却引发了他的超级听力，并听到了莱昂和克萝依的对话，并开始知道莱昂要克萝依调查他。莱克斯来探望克拉克，克拉克却无意将听到的话告诉他。莱昂以为是克萝依泄密，迁怒于她，解雇了他的父亲。抢劫主犯要出庭受审了，他的同伙捉了皮特来威胁法官。克拉克在父亲的帮助下适应了新的超能力，并及时运用这项新能力救出了皮特，惩治了抢劫犯。克拉克在失明时想起了拉娜的好处，但眼睛好起来之后却又犹豫了。拉娜很失望，她开始考虑和Adam的感情。
